Urząd Skarbowy w Zamościu obejmuje swoim zasięgiem: miasto na prawach powiatu – Zamość oraz gminy: Adamów, Grabowiec, Komarów-Osada, Krasnobród, Łabunie, Miączyn, Nielisz, Radecznica, Sitno, Skierbieszów, Stary Zamość, Sułów, Szczebrzeszyn, Zamość, Zwierzyniec.
W zakresie podatku akcyzowego i podatku od gier obejmuje swoim zasięgiem miasto Zamość oraz powiaty: zamojski, hrubieszowski, tomaszowski, biłgorajski
i janowski;